ATCC菌株在準備用於分配的菌株時，會進行大量的質量控製。(QC)檢測，確保產品在達到消費者手中之前達到高標準。為了確保菌株鑒定準確，培養物質純正，所有生化結果一致，所有菌株都經過了徹底的表型和基因型檢查。為了幫助維持這些標準，QC過程中所需的所有設備和生化測試都經過了類似的評估，以確保質量。以下描述了QC分析期間ATCC菌株通常對細菌菌株進行的一些測試。
當ATCC菌株一次接收菌株時，它們會分析它們的特征菌落和細菌形態;這是通過菌落生長和革蘭氏染色觀察到的。此外，在血瓊脂板上測試樣品的培養純度。不止一種菌落類型的存在通常並不總是表現混合文化。除純度和形態外，還應檢查菌株在糖代謝、抗生素敏感性和/或廣譜生化反應方麵的一致性。ATCC菌株通常使用適當的API條測試和Vitek卡，以確認細菌物種的身份。
上述兩種技術在反應細胞中使用了20多種不同的生化測試來評估細菌菌株的生長和活力。30API條測試通過手動微法表示細菌身份，該方法根據單個生化分析的反應生成七位數代碼。該代碼是一個與特定細菌類型相關的標誌符號。相比之下，Vitek係統提供了一種基於計算機的自動物種識別方法，通過測量與每種生化反應相關的光衰減。對於後一個係統，ATCC菌株需要30,31≥90%的生物識別概率。
