決於鑽孔的深度。該PVC管由一段濾水管和一段無縫管組成。濾水管的長度取決於地下水位的深度，每個孔內，濾水管從井底一直延伸到高於靜態水位以上約10 cm。監測井濾管周圍用大於0.25 mm的幹淨石英砂回填作為濾水層，並填至濾管以上20 cm。填砂過程中緩慢地將不鏽鋼套管拔出以防管壁坍塌。石英砂與地麵以下的空間不填入任何東西。在采集完水樣後，所有的PVC井管都被拔出，然後井孔用原土回填。

為了清除地下水中的混濁物，並確保采集到有代表性的水樣需洗井。洗井所抽出的水量相當於井中容量的5倍，直至抽出的水不混濁和沒有細顆粒,pH和電導率讀數穩定為止。所有井在采樣前均讓其穩定相當一段時間。

通過對鑽孔過程的詳細觀察弄清該場地的地質和地下水文特點。根據鑽孔記錄，使用統一的土壤分類係統和光離子化檢測器對場地輪廓進行描述，同時通過目視觀察頂部空間揮發性有機物的濃度和存在的水分、油品、顏色及氣味。此外，根據對各鑽孔地下水位的測量，確定場地地下水水位和流向，繪製示意圖(王華2005)。

在土壤監測中，采樣誤差對結果的影響往往大於製樣誤差和分析誤差。因此，在采樣過程中應嚴格遵循采樣的布點原則和方案，從采樣過程中的每一個環節控製采樣質量，盡可能地將采樣的誤差減至小，確保采集到的樣品有充分的代表性，能真實反映土壤實際狀況。

       從野外取回的土樣，經登記編號後，都需經過一個製備過程：風幹、磨細、過篩、混勻和裝瓶，以備各項測定之用。土壤重金屬一般采用烘千樣，半揮發性的持久性有機汙染物的分析一般采用冷凍幹燥樣；揮發性有機汙染物的測定一般用新鮮樣。新鮮樣可暫時保存於冰箱或冰櫃中，但須在10天內進行提取處理。

       從野外采回的土壤樣品要及時放在樣品盤上，攤成薄薄的一層，置於幹淨整潔的室內通風處自然風幹，嚴禁曝曬，並注意防止酸、堿等氣體及灰塵的汙染。風幹過程中要經常翻動土樣並將大塊捏碎以加速幹燥，同時剔除土壤以外的侵入體，細小已斷的植物須根，可用靜電吸附的方法清除。風幹後的土樣按照不同的分析要求研磨過篩，充分混勻後裝入樣品瓶中備用。重金屬分析樣要求過100目(0.149 mm)以上的篩，有機汙染物分析樣一般要求過60目(0.25 mm)篩。在處理樣品的每個過程中都要特別注意，對於用於重金屬分析的樣品，不要接觸金屬器具以免樣品受到汙染，一般采用瑪瑙研缽和尼龍網篩等；而用於有機汙染物分析的樣品，則應防止使用塑料工具。樣品瓶內、外各具標簽一張，寫明編號、采樣地點、土壤名稱、采樣深度、樣品粒徑、采樣日期、采樣人、製樣時間和製樣人等項目。

製備好的樣品要妥善儲存，避免日曬、高溫、潮濕和酸堿等氣體的汙染。在全部分析工作結束，分析數據核實無誤後，試樣一般還要保存3個月至半年，以備查詢。少數有價值需要長期保存的樣品，須保存於廣口瓶中，用蠟封好瓶口。有條件的地方，樣品應低溫保存。

       指示菌"一詞可用於任一群在分類學.生理學或生態學上相似的微生物.它們的存在與否可指示樣品在過去或現在所具有的而不能直接證明的某些特征。指示菌通常是腸道菌，但某些情況下其他菌群也可作為指示菌，例如，如果食品已經過熱處理，但依然存在革蘭氏陰性菌，說明熱處理不夠徹底(相對於這些細菌的起始數)或熱處理後又被汙染、大腸菌群隻是革蘭氏陰性菌的一類，對熱處理沒有太靈敏的指示作用，但現在仍使用大腸菌群計數檢測食品的熱處理後的效果，“指標菌"一詞是1977年由Ingram出，作為指示生態恃征相似的一類致病菌的可能存在的標誌，同時保留了上段所定義的指示菌含義。